RNA-centric view on Oligodendrocyte lineage development

Syfte och mål

Målet med detta projekt var att undersöka funktionen och verkningsmekanismen för långa icke-kodande RNA: er och RNA-bindande proteiner i oligodendrocytlinjen. Jag har framgångsrikt kännetecknat en stor djupmekanism och funktion hos en oligodendrocyt-specifik lncRNA med fokus på kromatintillstånd och kromatinarkitektur. Dessutom har jag etablerat encellsupplösningsteknologier - enkelcells Cut & Tag och enkelcells CRISPR-screening i labbet som kommer att ge extremt viktig inblick i reglering av oligodendrocytter differentiering.

Resultat och förväntade effekter

Resultaten av detta projekt är av stor betydelse för områdena lncRNA, kromatinarkitektur samt oligodendrocytutvecklingsbiologi. Först har jag visat i mycket mekanistisk detalj hur påverkar KO av ett specifikt lncRNA uttryck av angränsande gener. Sedan kommer undersökning av genuttryck, aktivitet och kromatintillstånd på encellsnivå under oligodendrocytter differentiering att vara av stort intresse för samhället. Vi förväntar oss att dessa bogseringsprojekt leder till två publikationer med medellång till hög effekt.

Upplägg och genomförande

Det föreslagna projektet har genomförts i delar enligt beskrivningen i förslaget. Jag tror att jag har uppfyllt huvudmålen och där det är möjligt utvidgat projektets omfattning - t.ex. optimerade och etablerade nya upplösningstekniker med en cell i labbet. Dessutom tillät projektet mig att utöka mitt professionella nätverk och gjorde det möjligt för mig att presentera erhållna data vid viktiga internationella konferenser.