Implementering av seriell kristallografi som rutinmässig metod för datainsamling hos SARomics Biostructures
| Diarienummer | |
| Koordinator | SARomics Biostructures AB |
| Bidrag från Vinnova | 390 000 kronor |
| Projektets löptid | november 2018 - november 2019 |
| Status | Avslutat |
| Utlysning | Forskningsinfrastrukturer - nyttiggörande och samverkan |
| Ansökningsomgång | Industriella pilotprojekt för neutron- och fotonexperiment vid storskalig forskningsinfrastruktur 2018 |
| Slutrapport | 2018-04409_SARomics_Biostructures.pdf(pdf, 383 kB) (In English) |
Syfte och mål
Det övergripande syftet var att SARomics personal skulle anamma seriekristallografitekniker. Vi genomförde viktiga proof-of-principle experiment på ett litet, relativt lättkristalliserat protein, galectin-3C. Dessa experiment utfördes vid strålröret BioMAX på MAX IV -laboratoriet och dess personal var centrala för framgången. Resultaten visade att vi rutinmässigt kan lösa strukturer från tiotusentals mikrokristaller. Detta kan vara det bästa sättet att tackla nya svårkristalliserade proteiner i framtiden. Resultaten kommer att publiceras i en vetenskaplig tidskrift.
Resultat och förväntade effekter
Projektet har gett SARomics personal värdefulla nya insikter och kompetenser i spjutspetstekniken seriell kristallografi. Denna metod för att samla diffraktionsdata kan komma väl till pass i framtida projekt med nya, svårkristalliserade proteiner, framförallt membranproteiner, eller i kundprojekt och interna projekt där data vid rumstemperatur är lämpligast. Projektet har utökat SARomics kompetensportfölj och kommer att leda till att företaget blir mer attraktiv i en kompetitiv marknad.
Upplägg och genomförande
Projektet har utförts som ett samarbete mellan SARomics Biostructures och personal vid strålröret BioMAX på MAX IV. SARomics utvecklade metoder för att göra stora mängder mikroskopiska kristaller av proteinet galectin-3C. Sedan utforskade SARomics tillsammans med BioMAX olika sätt att presentera dessa kristaller i strålen, att samla data på kristallerna och behandla de stora mängder data som uppstod. SARomics lärde sig nya tekniker samtidigt som BioMAX kunde testa sin hårdvara och mjukvara och öka intresset för seriell kristallografi bland industriella användare.