Improved information output from shotgun proteomics by high resolution peptide isoelectric focusing
| Diarienummer | |
| Koordinator | Karolinska Institutet - Institutionen för onkologi-patologi |
| Bidrag från Vinnova | 1 449 800 kronor |
| Projektets löptid | december 2011 - december 2018 |
| Status | Avslutat |
Syfte och mål
Målet med detta projekt var att utveckla dataanalysmetoder och metodik för förbättrad biologisk tolkning av masspektrometribaserad proteinanalys med hjälp av high resolution peptide isoelectric focusing (HiRIEF). Det har varit möjligt för mig att arbeta som projektledare för detta på Karolinska Institutet (KI) och som gästforskare vid GE Healthcare (GEH) genom finansiering från VINNOVA och KI, och ett bra samarbete mellan KI och GEH.
Resultat och förväntade effekter
Tillsammans med doktorander och postdocs i forskargruppen vid KI, ledd av professor Janne Lehtiö, har arbetet resulterat i ett flertal publikationer. Tolv artiklar i vetenskapliga peer-review tidskrifter där jag är medförfattare har publicerats inom ramen för projektet 2012 - 2018. HiRIEF som utvecklats tillsammans med GEH är avsedd för en klinisk marknad. Mina erfarenheter från forskning, företag och klinik under detta projekt kommer således att gynna framtida samarbeten.
Upplägg och genomförande
Som projektledare har jag varit drivande på Karolinska Institutet (KI), med forskningspublikationer som mål. På GE Healthcare (GEH) i Uppsala var jag gästforskare, det var en mycket lärorik period där jag fick möjlighet att förstå både möjligheter och svårigheter med samarbeten mellan akademi och industri. Tillbaka på KI har fokus varit på forskning och samfinansiering av forskningen med hjälp av bland andra GEH, vilket har varit framgångsrikt.