Transkriptomanalys av enskilda celler vid njursjukdom

Syfte och mål

Kronisk njursjukdom (CKD) utgör ett globalt hälsoproblem och resulterar ofta i terminal njursvikt (ESRD). Då förekomsten av de vanligaste bakomliggande orsakerna till CKD/ESRD diabetes, övervikt och högt blodtryck fortsätter att öka, förväntas även förekomsten och samhällskostnaderna för CKD/ESRD att växa. Därför har Haase-gruppen utvecklat nya metoder som kan hjälpa till vid tidig diagnos, förebyggande och behandling av CKD och minska de höga riskerna med hjärt-kärlsjukdomar, ESRD och död hos CKD-patienter.

Resultat och förväntade effekter

I samarbete med Karolinska Institutet och Uppsala Universitet, Prof. Volker H. Haase av Vanderbilt University har utvecklat tekniker för att identifiera nya molekylära biomarkörer med syfte att förbättra diagnostik och behandling av patienter med akuta och kroniska njursjukdomar. Detta projekt utnyttjar enkelcellsinriktningar och kombinerar nya tekniker och plattformar inom bioinformatik med experimentella djurmodeller.

Upplägg och genomförande

Projektet har använt avancerade genetiska och kirurgiska musmodeller utvecklade av professor Haase´s grupp för att undersöka betydelsen av syrgasmetabolism i patogenesen av njursjukdom. RNA-sekvenseringsteknologi användes för en detaljerad molekylär karakterisering av individuella renalcellspopulationer under baslinje och skada villkor (celler isolerades från normala, skadade och genetiskt modifierade njurar).