Utveckling av en plattform för epigenetiska biomarkörer i flytande biopsier

Syfte och mål

Nuvarande icke-invasiv diagnostik släpar ofta efter behandlingsframsteg i många sjukdomar, särskilt vid tidig upptäckt av cancer, där sen diagnos minskar överlevnaden och ökar kostnaderna. Befolkningsscreening är avgörande för ett hälsosamt liv och sjukdomshantering. Epigenicas mål är att utveckla sin egenutvecklade epigenetiskprofileringsteknik till en universell plattform för upptäckt av biomarkörer för flytande biopsier, vilket underlättar tidig upptäckt och sjukdomshantering.

Förväntade effekter och resultat

En plattform för att identifiera epigenetiska biomarkörer i flytande biopsier (universell för olika sjukdomar). Det första steget omfattar att utveckla vår teknologi för effektiv och skalbar epigenetisk analys av flytande biopsier, optimerad för en låg men tillämpbar volym från olika källor (tex plasma, ascites, CSF). Målet är att visa att vi kan uppnå en kvantitativ och multiplex analys av upp till 24 prover och 6-8 epigenetiska markörer, med plasma från cancerpatienter och friska kontroller.

Planerat upplägg och genomförande

Det första steget omfattar att utveckla vår teknologi för effektiv och skalbar epigenetisk analys av flytande biopsier, optimerad för en låg men tillämpbar volym från olika källor (tex plasma, ascites, CSF). Detta kommer att göras genom att optimera enzymatisk adapterligering, testa antikroppar mot 30-40 välkarakteriserade histon-PTM:er och optimera för olika material. Slutligen vill vi visa att den optimerade analysen med material från cirka 12 cancerpatienter och 12 kontrollprover fungerar.