Ultrakänslig detektion av fusionsonkogener i vätskebiopsier vid barncancer

Viktiga resultat som projektet gav

Projektet syftade till att kombinera teknikerna two-tailed PCR och SimSen Sekvensering för att ta fram känsliga assayer för detektion av cancerrelaterade fusionsonkogener. Dessa assayer skulle utvärderas hem avseende på specificitet, känslighet och möjlighet till multiplexing. De framtagna assyerna skulle också förberedas för kommersialisering.

Långsiktiga effekter som förväntas

Assayer för de tre mest relevanta fusionsonkogener i barncancer har tagits fram och validerats baserat på en kombination av teknikerna two-tailed PCR och SimSen sekvensering. Detta har resulterat i två patentansökningar. Ett företag för kommersialisering av tillämpningar har startats och diskussioner pågår med externa partner om samarbeten kring teknikerna.

Upplägg och genomförande

Projektet har utförts i samarbete mellan TATAA Biocenter, Göteborgs Universitet och Sahlgrenska sjukhuset. Teknikutbyte och assayutveckling har skett i nära samarbete mellan TATAA Biocenter och Göteborgs Universitet, samt Sahlgrenska Sjukhuset med relevant klinisk information för assaydesignen. Sahlgrenska Sjukhuset har samlat in material för utvärdering av de designade assayerna. Samtliga partner har också varit delaktiga i upplägget för kommersialisering.