Spatial proteomik analys av nya cancermodeller - för att verifiera relevans mot original tumören

Syfte och mål

Vi använder ett rekombinant funktionaliserat protein, FN-silk, för att tillverka förbättrade cancermodeller in vitro. FN-silk härmar den extracellulära matrisen och kan fånga heterogeniteten hos ett tumörprov och ge en relevant tumörmikromiljö. Vi kommer använda spatial proteomics vid Spatial proteomics unit, SciLifeLab, för att avgöra hur väl våra cancermodeller fångar de relevanta egenskaperna hos den ursprungliga tumören, som i stor utsträckning går förlorad med konventionella odlingsmetoder.

Förväntade effekter och resultat

Den tillförlitliga djupare karakteriseringen av de nya FN-silk baserade cancermodellerna som utförs i detta projekt kommer att belysa den förväntade heterogeniteten och relevansen jämfört med konventionella modeller. Dessa fördelar kommer att vara avgörande för att motivera övergången från konventionella cancermodeller till nya versioner som bättre representerar den ursprungliga tumören. Vidare strävar vi efter att inrikta oss på kliniska tillämpningar av cancermodellerna för precisionsmedicin.

Planerat upplägg och genomförande

Först kommer vi att konstruera cancermodeller med hjälp av etablerade bröstcancercellinjer och utföra spatiell proteomik för att undersöka effekten på cellinbindning och migration i FN-silk jämfört med sfäroider. Därefter kommer vi att använda primärt tumörmaterial för att konstruera patientspecifika tumörmodeller och undersöka den fångade heterogeniteten hos både tumörceller och omgivande stroma. Slutligen kommer vi att utföra ett först test med läkemedelsbehandling.