Bindning av nya peptider till nya ytreceptorer på bukspottkörtelceller

Viktiga resultat som projektet gav

Målet var att bedöma bindning av peptider till en specifik receptor med användning av röntgenkristallografimetoder. Receptorn producerades i laboratorie. Receptorn i komplex med peptider renades och kristalliserades därefter för att producera väldiffrakterande kristaller. Kristallstrukturen för receptorn bestämdes i komplex med en peptid vid 1,55 Å i upplösning. Bindningen har bekräftats med användning av traditionella laboratorietekniker med användning av både det renade proteinet, kommersiellt tillgängliga småskaliga proteinpartier och bindning på humana celler.

Långsiktiga effekter som förväntas

Bestämningen av kristallstrukturen för peptid/receptorkomplex gjordes vid mycket hög upplösning, 1,55 Å. Bindningen har bekräftats med traditionella laboratorietekniker, med fokus på celler och ex vivo -material som är involverade i inflammation och vävnadsreparation. Framtidsplaner är att utvärdera denna bindning ytterligare med hjälp av olika tekniker, för att förstå förmågan hos Follicum-peptider som potentiell medicinsk användning och utforska potentiella indikationer. Parallellt kommer Follicums peptider att jämföras med kända blockerare av receptorn.

Upplägg och genomförande

Receptorn i komplex med olika peptider renades för kristallisation i syfte att producera väldiffrakterande kristaller. Därefter samlades data in på I04 -strållinjen vid Diamond Light Source, Storbritannien. Strukturella data analyserades med SBX. Publicerade kristallstrukturer hos receptorn användes för att undersöka motsvarande eller överlappande bindning av andra molekyler till samma del av målproteinet. De erhållna strukturella resultaten översattes till biologisk funktion och etablering av verkningssätt också med användning av olika in vitro modeller.