Molnbaserad integrering av avancerad mjukvara för datagenerering och prediktion i läkemedelsutveckling

Syfte och mål

Genom att skapa en molnbaserad lösning kopplad till superdatorer tillgängliggör vi resurserna för fler användare. En superdator kommer att finnas en knapptryckning bort via en webbläsare. På resurserna kommer nyutvecklad världsledande programvara finnas tillgänglig och skräddarsydda arbetsflöden kommer att utvecklas. Dessa kommer att användas för storskalig datagenerering för träning av AI-modeller inom läkemedelsutveckling och för prediktion av molekylära egenskaper.

Förväntade effekter och resultat

En prototyp för molntjänsten kommer att skapas. Vi kommer att utvärdera användargränssnittet så att allt uppfattas som sömlöst och smidigt för användaren. Flera arbetsflöden ska testas där den nyutvecklade programvaran VeloxChem används för att generera data koppade till molekylära egenskaper som är av stor vikt för framgångsrik läkemedelsutveckling. På detta sätt tillgängliggörs Sveriges kraftfullaste superdatorer för fler användare och vi tar modern programvara från akademi till industri.

Planerat upplägg och genomförande

På KTH kommer molnlösningen att skapas och först testas internt. När en fungerande version är klar kommer AstraZenecas användare att ges tillgång. Specifika moduler som behövs för AstraZenecas läkemedelsutveckling kommer att skapas i VeloxChem och arbetsflöden baserade på Python kommer att skapas på KTH. AstraZeneca ansvarar för att ta fram molekylär inputdata till modellerna och för att utvärdera uppställningen. Datan kommer att testas i grafbaserade neurala nätverk.